Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubxn4Q8VCH8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubxn4Q8VCH8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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