Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim68Q8K243 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim68Q8K243 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim68Q8K243 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim68Q8K243 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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