Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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