Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme8Q715T0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms