Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms