Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edem3Q2HXL6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms