Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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