Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms