Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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