Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms