Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighmbp2P40694 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighmbp2P40694 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms