Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms