Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms