Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm8356J3QPD3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm8356J3QPD3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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