Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mpdu1Q9R0Q9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mpdu1Q9R0Q9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms