Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms