Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms