Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed11Q9D2R4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmed11Q9D2R4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmed11Q9D2R4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tmed11Q9D2R4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tmed11Q9D2R4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms