Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rpl11Q9CXW4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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