Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms