Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms