Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Fam107bQ3TGF2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Fam107bQ3TGF2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam107bQ3TGF2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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