Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRKQ15262 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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