Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sox13Q04891 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox13Q04891 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms