Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd22P35329 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms