Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms