Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04214 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04214 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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