Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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