Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Prrt1O35449 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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