Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms