Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNRIP1Q96F85 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNRIP1Q96F85 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms