Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp27Q8CEG8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp27Q8CEG8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp27Q8CEG8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp27Q8CEG8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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