Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms