Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VcpQ01853 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VcpQ01853 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms