Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms