Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms