Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFPL3SP0C7P2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms