Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa7P02830 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa7P02830 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms