Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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