Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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