Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms