Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms