Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms