Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl2Q78Y63 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms