Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gramd2bQ6PEM6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms