Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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ALX1Q15699 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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