Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms