Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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