Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01667 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01667 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01667 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01667 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01667 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01667 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01667 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms