Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms